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人と関わるのが苦手な礼香はゲーム会社でバグ探しのアルバイトをしていたが、ルームメイトの庸子と共に木造迷路に迷い込んでしまい!?ミステリーファンタジー。

ギリシャの哲学者プラトンはアトランティス王国の文書を求め、旅に出る。旅先のエルカシアでプラトンは太陽のような灯り（タウブ）、高度な調味料を使った食材、グラウス（ガラス）と今までに見たことのない高度な技術を持った文明に出会う。プラトンは、エルカシアの宗主にアトランティスがなぜ滅んだのかを尋ねる。宗主は「その問いはあなた自身で見つけることになる」との謎の言葉を残す。プラトンはその地で横になり、目が覚めると自分がアトランティスの司政官オリオナエであることを自覚する。

物語は「火の鳥」と呼ばれる鳥が登場し火の鳥の血を飲めば永遠の命を得られるという設定の元、主人公たちはその火の鳥と関わりながら悩み、苦しみ、闘い、残酷な運命に翻弄され続ける。

広瀬岬一は高校入学の朝、登校をすると奇妙な仮面をかぶった女子生徒に「お前の命を、もらいに来た。」と言われ追いかけられる。騒動の後、自身の体の異変に気づいた岬一はその女子生徒に再度会いに行く。そこで岬一は女子生徒に10年前に一度死にかけ、その時心臓を分けた宇宙人が自分であると言われる。女子生徒―――大鳥希は岬一に自分の仲間になって一緒に地球侵略をしようと誘ってきた。

30年前に消息を絶っていた祖父・洋一郎が南国カラバオで発見されてから少し後、ごく普通の小学生・日向陽の元に突如カラバオから嫁として少女・クニエが訪れてくる。そして彼女が持ってきた謎の卵から首長竜リンガナエが孵化するが、母がトカゲが苦手なために、パフと名付けられたその首長竜は密かに育てることとなった。一方カラバオでは沖に謎の杭が現れ、アメリカ軍が調査に乗り出していた。

四鷹市にあるアミューズメントゾーン“ドラゴン”に、最新鋭の超大型体感ゲーム施設“ゲームドーム（GD）”がオープンし、バーコードをマシンに入力して戦う新感覚ゲーム“バーコードファイター”が大人気となっていた。ゲームドームの特徴はVRシステムとドーム天井を覆う巨大モニターにある。プレイヤーは“シミュレーター”と呼ばれる筐体に乗り込み、HMDを装着してゲームを進める。観客はドームの天井一面を使った巨大なディスプレイで観戦することが出来るようになっている。 ある日、虎堂烈は幼馴染の有栖川桜に勧められてプレイするも一撃で敗退してしまう。しかし対戦相手の掛須巧に挑発され一念発起、リベンジを果たす。

西暦2051年、スーパーテクノロジー・神機力を独占する徳川神機力産業の台頭により、人類の社会は大きな変革の時を迎えようとしていた。首都・東京は神都と名を改め、そのシステムを高度にハイテク化、衣食住の全てを神機力に統一依存することによって、かつてないほどに機能的に運営されるようになっていた。しかし一方で、神機力を嫌う者、神機力を受け容れない者は容赦なく社会から排除され、消滅させられようとしていた。 その神都に1人の男が現れる。

人の夢を探査するプロの夢先案内人である渡会時夫のもとに、7年間眠り続ける少女、青羽の夢の探索依頼が舞い込む。 少女の夢の中には、人が空を飛べたり不老不死であったりするユートピアのような世界、バルバラが存在していた。 少女の夢の中の世界のはずなのに、時夫の息子キリヤはバルバラは自分が創った空想の島だと言い出す。 少女を目覚めさせるには夢の中で少女を不幸にすればよいと心理カウンセラーの目白が語った夜、キリヤの夢に青羽が現れ、目白は急死する。

近未来——全ての｢知｣は電子化され管理される｢ビブリオテック(電子図書の仮想都市)｣の時代。そのビブリオテックに異変が起こっていた。電子書籍全盛の近未来を軸に、人類最古の｢文字｣｢書物｣をも巻き込み、その歴史と共に紡がれる、壮大なSFファンタジー。

40年の歳月を経て「バビル2世」が奇跡の復活!!　今度の敵は最強軍事国家・アメリカ!!　現代兵器VSバビル2世の超能力バトル勃発